La presente publicación tiene la finalidad de contribuir a la identificación y diferenciación genética de los cultivares de cacao Peruano. Cuando se desarrollan nuevos cultivares, bien sea por selección, hibridación u otros métodos de mejoramiento genético, las instituciones científicas necesitan difundir los atributos agronómicos mejorados de estos nuevos materiales genéticos. En este ensayo se resalta el avance de la caracterización morfológica y clasificación taxonómica de 14 árboles híbridos seleccionados de cacao del Centro de Investigación y Producción Tulumayo perteneciente a la Universidad Nacional Agraria de la Selva (UNAS, Tingo María - Huánuco, Perú). Los resultados obtenidos muestran variación a nivel de frutos y semillas cuyo polimorfismo dependió del carácter evaluado. Se espera que la información aquí estudiada y analizada sea una valiosa referencia del estado del conocimiento científico y a la vez una herramienta orientadora para la toma de decisiones que conlleven al uso sostenible de los Recursos Genéticos del Cacao Peruano, contribuyendo a mejorar su productividad y calidad.